IMDEA Nanociencia es una fundación sin ánimo de lucro, establecida por la Comunidad Autónoma de Madrid con el apoyo financiero del Banco Europeo de Inversión y de fondos estructurales y sociales de la Unión Europea. La Fundación está gobernada por un comité científico independiente con representantes de los gobiernos central y regional, de universidades (UAM, UCM y UPM), del CSIC, de compañías privadas, científicos extranjeros y expertos en desarrollo tecnológico. El comité científico definió en su momento los siguientes objetivos para IMDEA Nanociencia: i) Atracción de talento en áreas estratégicas relacionadas con la Nanociencia, ii) Desarrollo de investigación de excelencia, iii) Desarrollo de un nuevo modelo de transferencia de tecnología basada en la incorporación de las necesidades de la industria y en la definición y apoyo financiero de las líneas de investigación.